Разработка панели экспрессионных маркеров для диагностики рецидива острых лейкозов

Известно, что до 50 процентов случаев острого миелоидного лейкоза не имеют информативных генетических маркеров. Таким образом достаточно актуальной является задача поиска универсальных маркеров, позволяющих проводить адекватную терапию в посттрансплантационном периоде.

Цели:

Оценить информативность панели экспрессионных маркеров WT1, BAALC, EVI1, PRAME при оценке вероятности развития рецидива острого миелоидного лейкоза (ОМЛ) у пациентов после аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТКМ).

Текущие результаты:

По данным экспрессии генов у здоровых доноров мы рассматривали в качестве порогового уровень экспрессии (эксп. ген/ABL x100) значения для WT1 – 250, для EVI1- 10, для BAALC – 20, для PRAME – 200. У пациентов, которым была выполнена трансплантация в рецидиве мы отметили наличие гиперэкспрессии генов EVI1 (p=0.006), WT1 (p<0.001), BAALC (p<0.001). Сходная тенденция наблюдалась и в отношении гена PRAME (p=0.08). При этом наличие гиперэкспрессии гена EVI1 наблюдалось у 6 пациентов (33%), WT1 – у 13 пациентов (72%), BAALC – у 10 пациентов (55%) и PRAME – у 4 пациентов (22%). При сопоставлении данных экспрессии генов и уровня химерных транскриптов PML-RARa и RUNX1-RUNX1T1 была выявлена корреляционная зависимость (p<0.05). В то же время, мы не обнаружили данной зависимости при сопоставлении с данными экспрессии химерного гена CBFB-MYH11. При анализе специфичности было выявлено, что при наличии химерного транскрипта менее чем в 2% клеток, позитивные ранее значения экспрессионных маркеров приобретают значения, сопоставимые с уровнем базальной экспрессии.

Публикации:

1. A.Shakirova, I.Barkhatov, O.Shakirova, O.Smykova, V.Teplyashina, Y.Gudozhnikova, S.Bondarenko, L.Zubarovskaya, B.Afanasyev. Gene expresion markers panel in posttransplant relapses evaluation. //Haematologica June 2015 100 (S1): P.651

2. Shakirova, A., Barkhatov, I., Shakirova, O., Teplyashina, V., Evdokimov, A., Gudozhnikova, Y., ... & Afanasyev, B. (2015, March). Evaluating of posttransplant relapse risk in patients with acute leukemia using the gene expression markers. Bone marrow transplantation (Vol. 50, pp. S240-S240).

Материалы:

Презентация (конференция НОДГО, июнь 2015)